1、读音不同
"卍"读音为（wàn）；"卐"读音为（fú或wàn ）
2 、来历不同
“卍”是上古时代许多部落的一种符咒，在古代印度 、波斯、希腊 、埃及 、特洛伊等国的历史上均有出现 ，后来被古代的一些宗教所沿用。最初人们把它看成是太阳或火的象征 ，以后普遍被作为吉祥的标志 。随着古代印度佛教的传播，“卍 ”字也传入中国 。
这个字梵文读“室利踞蹉洛刹那 ” ，意思是“吉祥海云相” ，也就是呈现在大海云天之间的吉祥象征。它被画在佛祖如来的胸部，被佛教徒认为是“瑞相 ”，能涌出宝光 ，“其光晃昱 ，有千百色 ” 。
中国佛教对“卍”字的翻译也不尽一致，北魏时期的一部经书把它译成“万”字 ，唐代玄奘等人将它译成“德 ”字 ，强调佛的功德无量，唐代女皇帝武则天又把它定为“万 ”字 ，意思是集天下一切吉祥功德 。
“卍”字有两种写法 ，一种是右旋，—种是左旋（“卐 ”）。佛家大多认为应以右旋为准 ，因为佛教以右旋为吉祥 ，佛家举行各种佛教仪式都是右旋进行的。
3、意义不同
这个被佛教徒视为吉祥和功德的具有神秘色彩的符号，被德国法西斯头子希特勒用来做了他的党旗标志 。当然这与佛教毫无关系 。
希特勒亲自设计的党旗为红底白圆心 ，中间嵌一个黑色“卐 ”字。希特勒对他们设计非常满意 ，认为“这是一个真正的象征” 。他在《我的奋斗》一书中说：“红色象征我们这个运动的社会意义，白色象征民族主义思想 。“卐 ”字象征争取雅利安人胜利斗争的使命。
后来，希特勒还为他的冲锋队员和党员设计了“卐 ”字臂章和“卐”字锦旗 。
至今佛教学术界对卍字到底应该是右旋还是左旋并没有取得最后的一致定论 ，但可以肯定的是 ，纳粹德国的“卐 ”字标志与佛教没有任何关联，一个是带给全人类无限惨痛记忆的战争恶魔标记 ，一个是延续了数千年之久象征着大爱与慈悲的佛教符号 ，两者无论其内涵与外延，都有着天壤之别 。